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分子砌块

药物发现平台

虚拟筛选

虚拟筛选(Virtual Screening)是一种在以计算机辅助药物设计为基础构建的虚拟小分子化合物库中筛选出苗头或先导化合物的计算方法,和传统的高通量筛选(HTS)相比,它具备化合物库容量大,化学结构多样性优越,筛选成本较低,以及周期快速等特点。目前虚拟筛选已经成为了主要的药物发现技术之一,并得到广泛的运用。基于药石科技独特的类药性分子砌块资源,我们已构建了超大容量的特色虚拟化合物库,可以进行快速和高质量的虚拟筛选,获得更多结构新颖,高成药性的苗头或先导化合物

筛选方法

•   基于结构的药物设计:晶体结构分析、分子设计、蛋白模拟、分子对接、虚拟筛选、靶点成药性评估

•   基于配体的药物设计:构象分析、化合物叠加、骨架跃迁、形状匹配、药效团模拟和搜索

•   化学信息:化合物数据库设计、高通量筛选、先导化合物扩展、SAR分析、数据挖掘和分析

筛选流程

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计算化学软件

PyMOL

Schrodinger Drug Discovery

SuiteCCG MOE


虚拟化合物库

•    结构多样性虚拟库(逾10亿个分子)— 基于不同系列的类药性分子砌块组合和多样性的化学反应

•    特殊虚拟库 — 以特定的结构划分:如激酶、溴结构域等;以特定分子大小划分:传统分子量、中等以及低分子量